Habe die vorherige FW 4.3.4.0597 wieder installiert und nochmal einen Rebuild mit ca. 8 Stunden abgewartet, welcher diesmal erfolgreich durchgelaufen ist. Zur Sicherheit hab ich den Lüfter während des Rebuilds auf mittlere Drehzahl gedreht, vielleicht hatte das auch einen Einfluss auf den Vorgang. Seither ist das NAS ohne Probleme durchgelaufen und ich hab in den Logdateien keinen Fehler mehr entdeckt.
Der Supportmitarbeiter konnte den Fehler in keiner Datenbank entdecken und hat gemeint, ich sollte das System genau beobachten. Zur Sicherheit werde ich eventuell das WD-Scantool auf beide Platten schicken, da das System bereits einige Rebuilds durchgemacht hat. Solange in den Changelogs keine Verbesserungen erwähnt werden, gibt es erst mal keine FW-Updates mehr.