mit meiner bisherigen externen USB Platte hat das funktioniert, weil die Elektronik des externen Samsung HD diese automatisch nach 10 min inaktivität in Standby versetzte.
Nun habe ich eine neue HD in ein externes eSATA Gehäuse eingebaut und diese Platte ist über eSATA am Qnap 119 angeschlossen. Die ext. HD läuft nun durchgehend während die interne in Standby geht.