Also, ich möchte das ganze jetzt doch nochmal auflösen.
Da ich vom Support nochmal die Bestätigung erhalten habe, dass die 100 Stunden Initialisierung nicht richtig seien (Email s.u.) habe ich folgendes erstmal selber gemacht:
Zunächst habe ich das NAS rebootet.
Daraufhin hatte er nur ein unmounted Raid5 Volume in der Liste.
Dieses habe ich entfernt und die drei einzelnen Single Disk Volumes die er mir dann anzeigte einzeln formatiert.
Anschließend habe ich nochmal ein Raid5 angestellt und siehe da, nach 20 Minuten war es fertig erstellt und die Synchronisation dauerte dann ca 10h, wurde allerdings auch brav mit Fortschritt angezeigt 
Hier noch der Vollständigkeit halber die Email des Supports:
ZitatAlles anzeigenBrechen Sie da sganze ab, solange darf dies nciht dauern.
Formatieren Sie dann die Platten mit diesem Tool:
Nutzen Sie zum formatieren an einem PC folgendes Tool damit der MBR auf den Platten überschrieben wird:
http://hddguru.com/software/HDD-LLF-Low-Level-Format-Tool/
HDD Low Level Format Tool 2.36 build 1181
HDD Low Level Format Tool: Führt eine Low-Level-Formatierung auf Festplatten und Speicherkarten durch, bei der der Datenträger physikalisch in Spuren und Sektoren eingeteilt wird; löscht dabei alle Daten, auch den Master Boot Record (MBR) unwiderruflich und unterstützt nahezu alle Typen, darunter S-ATA (SATA), IDE (E-IDE), SCSI, USB und Firewire; das Tool sollte nur von erfahrenen Nutzern angewendet werden.
Danach die Platten einbauen und die RAID-5 Konfiguration anstoßen.
Vielleicht hilft dieser Thread ja zukünftigen QNAP-Usern die ähnliche Probleme haben.
