Hängt doch mal nen Rechner mit Wireshark an den Switch, dann seht ihr doch ob das WOL Paket durch kommt oder nicht
Der Switch sollte wirklich mit einfachen Tests als Fehlerquelle auszuschließen sein.
Ausserdem könntet ihr mal mit gerichteten (Ethernet Ziel MAC ist die des QNAP) oder broadcast (Ethernet Ziel MAC ist FF:...:FF) Magic Packets testen.