Ist das hier eventuell die Ursache für die Probleme?
http://www.gossamer-threads.com/lists/linux/kernel/903485
Kurze Zusamenfassung:
Die GP-Festplatten sind für den Betrieb mit Windows ausgelegt. Beim Betrieb mit Linux kann die Platte nicht in den Ruhezustand wechseln und benötgt daher mehr Strom (und erzeugt auch mehr Wärme). Außerdem wird die Lebensdauer der Festplatten durch die ständigen Lade- und Entladevorgänge der Köpfe stark reduziert.
- Christoph