Die Suchpfade funktionieren nur in der Konsole. Sobald man Scripte durch crontab, QPKGs oder durch die autorun gestartet werden, müssen die Programmaufrufe mit dem kompletten Pfad des Programmes oder Scriptes verwendet werden.
Evtl. gibt es auch die Möglichkeit das Profil von der der autorun aufzurufen, damit man die Suchpfade auch im Script nutzen kann, aber das weiß ich nicht.